Wyjaśnienie: Jak szybko rozprzestrzenia się nowy szczep koronawirusa? Czy wpłynie to na szczepienie?

Nowy szczep koronawirusa w Wielkiej Brytanii: Indie i kilka innych krajów zawiesiły loty do iz Wielkiej Brytanii. Jakie mutacje doprowadziły do ​​powstania wariantu koronawirusa, który budzi niepokój? Jak szybko się rozprzestrzenia? I czy wpłynie to na szczepienia?

Loty z Wielkiej Brytanii są odwołane na lotnisku Cointrin w Genewie, Szwajcaria, 21 grudnia 2020 r. (Zdjęcie Reuters: Denis Balibouse)

W poniedziałek Indie zawiesił wszystkie loty zi do Wielkiej Brytanii do 31 grudnia, w związku z obawami o nowy wariant SARS-CoV-2, który szybko się tam rozprzestrzenia i rośnie. Kilka innych krajów również zawiesiło loty w Wielkiej Brytanii i nałożyło ograniczenia dotyczące podróży.

Jakie są te obawy prowadzące do ograniczeń w podróżowaniu?

W zeszłym tygodniu ujawniono, że nowy wariant SARS-CoV-2 jest przyczyną gwałtownego wzrostu liczby przypadków Covid-19 w południowej i wschodniej Anglii. Jest on określany jako VUI (wariant objęty dochodzeniem) 202012/01 lub rodowód B.1.1.7.

W ciągu ostatnich kilku dni, dzięki naszym światowej klasy zdolnościom genomowym, zidentyfikowaliśmy nowy wariant koronawirusa, który może być związany z szybszym rozprzestrzenianiem się w południowej Anglii, powiedział brytyjski minister zdrowia Matt Hancock w Izbie Gmin. 14 grudnia. Władze Wielkiej Brytanii powiadomiły już Światową Organizację Zdrowia o wariancie.

Public Health England (PHE) ogłosił, że do 13 grudnia zidentyfikowano 1108 przypadków tego wariantu, głównie w południowej i wschodniej Anglii. PHE współpracuje z partnerami w celu zbadania i planuje podzielić się swoimi odkryciami w ciągu najbliższych 2 tygodni.

Jaki jest wariant?

Wariant został zidentyfikowany w ramach nadzoru genomicznego przez konsorcjum COVID-19 Genomics UK (COG-UK), które analizuje dane z sekwencjonowania genomu z Wielkiej Brytanii. COG-UK jest największym dostawcą globalnej bazy danych Covid-19 GISAID.

Wariant jest wynikiem wielu mutacji w białku wypustkowym nowego koronawirusa SARS-CoV-2, a także mutacji w innych regionach genomowych wirusa RNA. Wstępna analiza sugeruje, że jest on bardziej przenośny niż wcześniej krążące warianty. COG-UK zidentyfikował jedną z tych mutacji jako N501Y w obszarze białka wypustkowego, które wiąże się z kluczowym białkiem w ludzkiej komórce, receptorem ACE2. To wskazywało, że zmiany mogą teoretycznie spowodować, że wirus stanie się bardziej zakaźny. Konsorcjum poinformowało, że trwają starania, aby potwierdzić, czy którakolwiek z tych mutacji przyczynia się do zwiększonej transmisji.

Co wiemy do tej pory na temat przenoszenia i ciężkości choroby?

W niedzielę PHE powiedział, że dane z sekwencjonowania całego genomu, epidemiologii i modelowania sugerują, że nowy wariant przenosi się łatwiej niż inne szczepy.

Podkreślono jednak również, że nie ma dowodów na to, że wariant z większym prawdopodobieństwem spowoduje ciężką chorobę lub śmiertelność. … Ale kontynuujemy badania, aby to lepiej zrozumieć, powiedział. Powiedział, że śmiertelność jest wskaźnikiem opóźnionym i będzie to stale monitorować w nadchodzących tygodniach.

PHE powiedział, że nie zna jeszcze mechanizmu tego wzrostu transmisji. Wiemy, że mutacje w białku kolczastym, części wirusa, która powoduje, że jest on zakaźny, mogą zmienić sposób, w jaki wirus oddziałuje z ludzkimi komórkami.

Stwierdzono, że dowody wskazują, że wskaźniki infekcji w obszarach geograficznych, w których krąży ten konkretny szczep, wzrosły szybciej niż oczekiwano, a dowody modelowania wykazały, że ten wariant ma wyższą prędkość przenoszenia niż inne warianty w obecnym obiegu.

Nowy szczep koronawirusa w Wielkiej Brytanii: Policjant kieruje ruchem przy wejściu do zamkniętego terminalu promowego w Dover w Anglii, w poniedziałek, po zamknięciu portu w Dover. (Zdjęcie AP)

Jak bardzo niepokojąca jest wyższa przepuszczalność?

18 grudnia grupa doradcza ds. nowych i pojawiających się wirusów układu oddechowego (NERVTAG), która doradza rządowi Wielkiej Brytanii w sprawie zagrożenia stwarzanego przez nowe i pojawiające się wirusy układu oddechowego, powiedziała, że ​​nowy wariant może potencjalnie zwiększyć liczbę reprodukcji choroby nawet o 0,93 . Powiedział, że ma umiarkowaną pewność, że nowy wariant wykazuje znaczny wzrost przepuszczalności w porównaniu z innymi wariantami.

Organ ekspercki stwierdził jednak, że obecnie nie ma wystarczających danych, aby wyciągnąć jakiekolwiek wnioski na temat podstawowego mechanizmu zwiększonej zakaźności, rozkładu wiekowego przypadków i nasilenia choroby. Powiedział, że zidentyfikowano 4 zgony na około 1000 przypadków, ale potrzebne są dalsze prace, aby porównać ten wskaźnik śmiertelności z porównywalnymi zestawami danych.

Lokalizacja mutacji w domenie wiążącej receptor glikoproteiny wypustek stwarza możliwość, że wariant ten jest antygenowo odmienny od wcześniejszych wariantów. Wśród 915 pacjentów z tym wariantem zidentyfikowano cztery prawdopodobne reinfekcje, ale potrzebne są dalsze prace, aby porównać ten wskaźnik reinfekcji z porównywalnymi zestawami danych.

W niedzielę w raporcie oceny zagrożenia opublikowanym przez Europejskie Centrum ds. Zapobiegania i Kontroli Chorób stwierdzono, że analiza filogenetyczna ujawnia, że ​​klaster różni się 29 podstawieniami nukleotydów od oryginalnego szczepu Wuhan. Trzy sekwencje z Danii i jedna z Australii, z próbek zebranych w listopadzie 2020 r., skupiają się z wariantem brytyjskim, najprawdopodobniej wskazując, że doszło do międzynarodowego rozprzestrzeniania się, chociaż zakres pozostaje nieznany.

Nowy szczep koronawirusa w Wielkiej Brytanii: Port w Dover zostaje zamknięty, ponieważ kraje UE nakładają zakaz podróżowania z Wielkiej Brytanii. (Zdjęcie Reutera)

Ale czy wirus nie uległ wcześniej mutacji?

Za każdym razem, gdy wirus replikuje się i krąży w populacji ludzkiej, mutacje występują naturalnie, z szybkością około jednej do dwóch mutacji miesięcznie w globalnej filogenezie.

W rzeczywistości, w przypadku SARS-CoV-2, COG-UK twierdzi, że obecnie w białku kolcowym występuje około 4000 mutacji. Wariant D614G był wcześniej dominującym szczepem, ponieważ bardzo łatwo się rozprzestrzeniał. Kolejna odmiana pochodząca od hiszpańskich rolników, 20A. EU1 latem szybko rozprzestrzenił się w całej Europie.

Trudno przewidzieć, czy jakakolwiek dana mutacja jest ważna, gdy po raz pierwszy się pojawia, na tle ciągłego pojawiania się nowych mutacji. Zrozumienie ich znaczenia może być możliwe na podstawie prac eksperymentalnych, które pokazują związek między mutacją a subtelną zmianą w biologii wirusa. Jednak przetestowanie wpływu wielu tysięcy kombinacji mutacji zajęłoby dużo czasu i wysiłku, powiedział COG-UK.

Czy wpłynie to na rozwój i odpowiedź na szczepionki?

W niedzielę władze Wielkiej Brytanii poinformowały, że dalsze prace laboratoryjne są podejmowane priorytetowo, aby to zrozumieć. Obecnie nie ma dowodów sugerujących, że szczepionka Pfizer nie chroniłaby ludzi przed nowym szczepem, powiedział PHE.

Podziel Się Z Przyjaciółmi: