Wyjaśniono: wariant B.1.617 i wzrost Covid-19 w Indiach

Dane z sekwencjonowania genomu dostarczyły dowodów na istnienie „podwójnego mutanta” w 61% próbek w Maharashtra. Ale czy ten nowy wariant napędza trwający wzrost w Indiach, można powiedzieć dopiero po udostępnieniu większej ilości danych.

Pracownicy służby zdrowia przygotowują łóżka w Shehnai Banquet Hall w New Delhi, która została przekształcona w tymczasowy oddział dla pacjentów z Covid-9. (Ekspresowe zdjęcie: Amit Mehra)

Podczas spotkania z laboratoriami okręgowymi w Maharashtra w zeszłym tygodniu, Narodowy Instytut Wirusologii (NIV) udostępnił ograniczone dane pokazujące rozpad 361 próbek zsekwencjonowanych genomu zebranych między styczniem a marcem tego roku.

Nagłówek znaleziska z analiza : obecność podwójnej mutacji wykryto w 220 — prawie 61 procent — próbek. Ten podwójny wariant został w zeszłym tygodniu sklasyfikowany jako wariant B.1.617.

Biuletyn Informacyjny| Kliknij, aby uzyskać najlepsze objaśnienia dnia w swojej skrzynce odbiorczej

Co to jest B.1.617?

Wariant B.1.617 SARS-CoV-2 niesie dwie mutacje, E484Q i L452R. Oba występują osobno w wielu innych wariantach koronawirusa, ale po raz pierwszy zostały zgłoszone razem w Indiach.

Dwie mutacje znajdują się w białku kolczastym wirusa. Białko kolczaste pomaga wirusowi związać się z receptorami komórki ludzkiej i uzyskać dostęp do komórki gospodarza.

Mutacja E484Q jest podobna do E484K, mutacji występującej w wariantach koronawirusa w Wielkiej Brytanii (linia B.1.1.7) i Afryce Południowej (B.1.351).

Mutację L452R znaleziono w szybko rozprzestrzeniających się wariantach w Kalifornii (B.1.427 i B.1.429). Może zwiększać siłę wiązania białek kolczastych z receptorami ACE2 na komórkach ludzkich, czyniąc je bardziej przenośnymi. L452R może również potencjalnie zwiększać replikację wirusa.

Razem E484Q i L452R są bardziej zakaźne i mogą unikać przeciwciał.

Gdzie znaleziono B.1.617?

Dane są ograniczone. Po raz pierwszy doniesiono o tym z Maharashtra. W styczniu zsekwencjonowano 19 próbek z różnych okręgów, a B.1.617 znaleziono w czterech. W lutym zsekwencjonowano 234 próbki z 18 okręgów, a 151 próbek — z co najmniej 16 okręgów — miało ten wariant. A w marcu miało go aż 65 z 94 próbek.

Jak dotąd okręgi Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad i Chandrapur przedstawiły mocne dowody na obecność B.1.617. Mniej próbek zsekwencjonowano w innych okręgach, aw niektórych znaleziono wariant. Oczekuje na sekwencjonowanie większej liczby próbek.

DOŁĄCZ TERAZ :Ekspresowy kanał telegramu z wyjaśnieniem

Czy ten wariant jest bardziej zjadliwy?

Jak dotąd nie ma dowodów. Większość pacjentów może poradzić sobie z izolacją w domu, chociaż doświadczenie kliniczne należy połączyć z danymi z sekwencjonowania genomu, aby uzyskać dowody naukowe. Anegdoty kliniczne lekarzy sugerują, że wariant rozprzestrzenia się szybciej, jest bardziej zakaźny, może zarażać całe rodziny, ale jest mniej zjadliwy i nie powoduje dramatycznie większej liczby hospitalizacji.

Większość pacjentów jest bezobjawowa i jest to dobre wskazanie. Ale w liczbach bezwzględnych tak wiele przypadków obciążyło infrastrukturę zdrowotną, powiedział dr Shashank Joshi, ekspert w grupie zadaniowej Maharashtra Covid.

Jak bardzo to się rozprzestrzeniło?

Dr Sujeet Singh, dyrektor Narodowego Centrum Kontroli Chorób (NCDC) zwrócił uwagę, że do tej pory zsekwencjonowano bardzo niewiele próbek z Maharashtry i jest zbyt wcześnie, aby wyciągnąć ostateczne wnioski na temat rozpowszechnienia podwójnego mutanta. Jednak rząd centralny poinformował w marcu, że 15-20 procent próbek w Maharashtra miało ten wariant; na podstawie najnowszych danych sekwencjonowania wiemy, że liczba ta wynosi obecnie ponad 60 proc.

Lekarze klinicyści i administratorzy okręgów w Maharashtra donoszą, że w przeciwieństwie do pierwszej fali, w drugiej fali zarażają się całe rodziny. Może to wskazywać, że fizyczna odległość i środki izolacji są niewystarczające w gospodarstwie domowym lub że wirus stał się bardziej zakaźny.

Czy B.1.617 może napędzać trwający wzrost liczby przypadków Covid-19?

Dr Gangandeep Kang, profesor mikrobiologii w Christian Medical College w Vellore, powiedział, że 60,9 procent próbek zawierających ten wariant najprawdopodobniej wykazało związek między mutacją a wzrostem – jednak dla dokładnej odpowiedzi co najmniej 1 procent próbek Covid-19 musi być sekwencjonowany co tydzień. W Indiach obecnie testuje się ponad 1 lakh przypadków dziennie, co przekłada się na około 1000 sekwencji genomowych każdego dnia.

Musimy również przyjrzeć się, ile osób dana osoba jest w stanie zarazić oraz próg cyklu RT-PCR. Musimy śledzić na żywo. Dane ze stycznia mają niewielką wartość w kwietniu, powiedział dr Kang.

Dr Gautam Menon, profesor na Uniwersytecie Ashoka w Sonepat oraz w Instytucie Nauk Matematycznych w Chennai, powiedział: To, co mamy, jest sugestywne, ale potrzebujemy więcej danych z sekwencjonowania genomu, aby zrozumieć, który wariant napędza liczbę nowych infekcji w różnych stanach… Aby zasugerować, że wzrost liczby przypadków jest spowodowany tym wariantem podwójnej mutacji, powinniśmy mieć więcej punktów czasowych. Na przykład, gdybyśmy mogli powiedzieć, że 30 procent tego wariantu wykryliśmy w próbkach 30 marca, a następnie 40 procent w próbkach 14 kwietnia, oznaczałoby to, że nowy wariant dominuje w rozprzestrzenianiu się choroby.

Dr Menon również podkreślił potrzebę większej przejrzystości danych. Jest możliwe, choć coraz bardziej nieprawdopodobne, że przypadki mogą być również powiązane z poprzednim szczepem, powiedział. Dopóki nie wiemy, w jakim stopniu wzrost można przypisać nowemu wariantowi, nie będziemy w stanie jednoznacznie określić, czy relaksacje w odpowiednim zachowaniu Covida ze starszym szczepem powodowały wzrosty, czy też jest za to odpowiedzialna zwiększona zakaźność nowego wariantu.

Prof. Vinod Scaria, główny naukowiec CSIR-IGIB, zgodził się, że nie możemy jednoznacznie stwierdzić, że te warianty napędzają wzrost w drugiej fali. Jednak dowody sugerują, że przynajmniej w niektórych stanach linia B.1.1617 jest dominująca i może przyczyniać się do wzrostu liczby przypadków, powiedział. Linia ta jest zdefiniowana przez 15 wariantów genetycznych, w tym sześć wariantów białka wypustkowego. Dwa z nich (E484Q i L452R) biorą udział w ucieczce immunologicznej, a także zwiększonej zakaźności, powiedział prof. Scaria.

Czy wariant może uniknąć szczepień?

Znowu dane są ograniczone. Niektórzy ludzie rzeczywiście zostali zarażeni po pierwszej dawce, ale nie ma danych na temat tego, czy ich próbki zostały wysłane do sekwencjonowania genomu.

Wiemy, że wariant południowoafrykański jest bardziej zdolny do uniknięcia odpowiedzi immunologicznej. Wiemy, że wariant brytyjski jest najbardziej przepuszczalny. Ale jak dotąd nic nie wiemy o B.1.617, ponieważ nie gromadzimy danych, aby wyciągnąć wnioski, powiedział dr Kang.

Dr Menon podkreślił, że chociaż nie oczekuje się, że szczepionki zapobiegną infekcji, z pewnością zapobiegają poważnym chorobom i śmierci. Spodziewamy się, że tak pozostanie nawet w nowym wariancie. Jedynym średnio- i długoterminowym rozwiązaniem problemu Covid-19 jest zaszczepienie ludzi.

Podziel Się Z Przyjaciółmi: