Wyjaśnienie: Co to jest „wartość CT” w teście Covid-19 i dlaczego jest to ważne?

Wartość progowa cyklu pojawia się w testach RT-PCR na koronawirusa i określa, czy dana osoba jest dodatnia na Covid-19, czy nie. W jakim stopniu koreluje z wiremią i ciężkością choroby?

Test RT-PCR wykrywa wirusa; Wartość Ct wyznacza punkt odniesienia dla tego, czy dana osoba ma być uznana za dodatnią. (Ekspresowe zdjęcie: Amit Mehra)

Wśród różnych terminów naukowych, które pandemia Covid-19 wprowadziła do słownika publicznego, jednym z nich jest „wartość Ct” w testach RT-PCR w celu określenia, czy pacjent jest pozytywny na Covid-19.

Było to przedmiotem niedawnej prośby wysłanej przez rząd Maharashtra do Indyjskiej Rady Badań Medycznych (ICMR). Stan dążył do wyjaśnienia, czy wskazane jest traktowanie osoby z ujemnym wynikiem Covid, jeśli wartość Ct jest większa niż 24, a osoba jest bezobjawowa. Urzędnicy państwowi stwierdzili, że różne dokumenty ICMR wspominały o różnych wartościach Ct i istniały rozbieżne poglądy nawet wśród Niti Aayog i Narodowego Centrum Kontroli Chorób.

Kilka dni później DG ICMR odpisała stanowemu sekretarzowi zdrowia, że ​​ICMR wykorzystał dane z laboratoriów wirusologicznych w całym kraju, aby uzyskać pojedynczą wartość graniczną Ct. Wszyscy pacjenci z wartością Ct mniejszą niż 35 mogą być uznani za dodatnich, podczas gdy ci z wartością Ct powyżej 35 mogą być uznani za ujemnych, powiedział ICMR.

Ale jaka jest wartość Ct?

Skrót od progu cyklu, Ct jest wartością, która pojawia się podczas testów RT-PCR, złotym standardem wykrywania koronawirusa SARS-CoV-2. W teście RT-PCR RNA jest ekstrahowane z wymazu pobranego od pacjenta. Jest następnie przekształcany w DNA, które jest następnie wzmacniane. Amplifikacja odnosi się do procesu tworzenia wielu kopii materiału genetycznego — w tym przypadku DNA. Poprawia to zdolność testu do wykrywania obecności wirusa. Amplifikacja odbywa się w serii cykli — jedna kopia staje się dwiema, dwie — czterema itd. — i po wielu cyklach wytwarzana jest wykrywalna ilość wirusa.

Zgodnie z zaleceniami ICMR, wartość Ct reakcji RT-PCR to liczba cykli, w których fluorescencja produktu PCR jest wykrywalna ponad sygnałem tła. Mówiąc prościej, wartość Ct odnosi się do liczby cykli, po których wirus może zostać wykryty. Jeśli wymagana jest większa liczba cykli, oznacza to, że wirus nie został wykryty, gdy liczba cykli była mniejsza. Im niższa wartość Ct, tym wyższe miano wirusa — ponieważ wirus został wykryty po mniejszej liczbie cykli.

Biuletyn Informacyjny| Kliknij, aby uzyskać najlepsze objaśnienia dnia w swojej skrzynce odbiorczej

Dlaczego wartość CT jest ważna?

Aby umieścić to w kontekście, spójrzmy na zalecenie ICMR i list Maharashtry do ICMR. Zgodnie z ICMR pacjent jest uważany za dodatniego, jeśli wartość Ct jest poniżej 35. Innymi słowy, jeśli wirus jest wykrywalny po 35 cyklach lub wcześniej, pacjent jest uważany za dodatniego. Jeśli benchmark miałby zostać obniżony do 24 — wartości wspomnianej w liście Maharashtry — oznaczałoby to, że wartości Ct w przedziale 25-34 nie zostałyby uznane za dodatnie. Punkt odniesienia wynoszący 35 oznacza zatem, że więcej pacjentów zostanie uznanych za pozytywnych niż uzyskalibyśmy, gdyby punkt odniesienia wynosił 24. ICMR stwierdził, że obniżenie parametru progu Ct może prowadzić do pominięcia kilku osób zakaźnych.

Można myśleć o wartości Ct jako o mierze potencjału transmisji, powiedział czołowy wirusolog dr Shahid Jameel. Więc jeśli będzie więcej wirusa w moim gardle i nosie, przekażę go lepiej, powiedział dr Jameel, który jest dyrektorem Trivedi School of Biosciences na Uniwersytecie Ashoka.

Jakie znaczenie ma próg ICMR wynoszący 35?

Na całym świecie przyjęta wartość graniczna Ct dla Covid-19 wynosi od 35 do 40, w zależności od instrukcji od odpowiednich producentów sprzętu badawczego. ICMR osiągnął wartość Ct 35 na podstawie doświadczeń laboratoryjnych i danych wejściowych z kilku laboratoriów wirusologicznych.

Nie było nowego zalecenia, ale ICMR poinformował rząd stanu Maharashtra, że ​​nie zaleca się stosowania niższego parametru progu cyklu, ponieważ doprowadziłoby to do utraty kilku osób zakaźnych i zwiększenia przenoszenia chorób, powiedział dr Balram Bhargava, DG ICMR.

Czy istnieje jakakolwiek korelacja między wartością Ct a nasileniem choroby?

Eksperci twierdzą, że chociaż wartość Ct jest odwrotnie skorelowana z wiremią, nie ma to żadnego wpływu na ciężkość choroby. Pacjentka może mieć niską wartość Ct, co oznacza, że ​​jej wiremia jest wystarczająco wysoka, aby można ją było szybko wykryć, ale nadal może być bezobjawowa.

Niewielkie badanie opublikowane w Indian Journal of Medical Microbiology w styczniu tego roku wykazało, że nie ma korelacji między wartościami Ct a nasileniem choroby lub śmiertelnością u pacjentów z chorobą Covid-19. Stwierdzono, że czas od wystąpienia objawów ma silniejszy związek z wartościami Ct w porównaniu z ciężkością choroby.

Wartość Ct mówi nam o obciążeniu wirusem w gardle, a nie w płucach, powiedział dr Parikshit Prayag, konsultant ds. chorób zakaźnych w Deenanath Mangeshkar Hospital w Pune. Wartość Ct nie koreluje z nasileniem – tylko z zakaźnością. W pierwszym raporcie tak naprawdę nie patrzę na wartość Ct, ale w przypadku obserwacji pacjentów w szpitalu uwzględniam wartość Ct, ponieważ wtedy mogę zdecydować, czy przenieść pacjenta do budynku nie-Covid, czy nie . Z punktu widzenia zakaźności może to mieć znaczenie, a nie dotkliwość, powiedział dr Prayag.

Czy wysoka wartość Ct zawsze oznacza niską wiremię?

Chociaż może to być oczywisty wniosek, niektórzy eksperci podkreślają, że niektórzy pacjenci mogą mieć wysoką wartość Ct, a jednocześnie mają bardzo znaczny poziom zakażenia Covid-19 i odwrotnie. Wiele czynników ma znaczenie w interpretacji testu RT-PCR, a wyniki mogą również zależeć od metody pobrania próbki oraz czasu od zakażenia do pobrania i analizy.

W zaleceniu ICMR z sierpnia zeszłego roku stwierdzono, że wartości Ct zależą od sposobu pobrania próbki. Źle pobrana próbka może odzwierciedlać niewłaściwe wartości Ct. Poza tym wartości Ct są również determinowane przez kompetencje techniczne osoby wykonującej badanie, kalibrację sprzętu oraz umiejętności analityczne tłumaczy.

Ponownie, wartości Ct mogą się różnić w próbkach z nosa i jamy ustnej i gardła pobranych od tego samego osobnika. Temperatura transportu, a także czas od pobrania do odbioru w laboratorium, mogą również niekorzystnie wpływać na wartości Ct.

Podziel Się Z Przyjaciółmi: