Nowe badania: identyfikacja potencjalnych celów dla leków, które mogą działać przeciwko wszystkim koronawirusom
Leki często wiążą się w kieszeniach białek, które dobrze trzymają lek, powodując, że zakłóca on funkcję białka. Naukowcy mogą zidentyfikować potencjalne kieszenie wiążące lek na podstawie trójwymiarowych struktur białek wirusowych.
Zgłosili swoje odkrycia w Journal of Proteome Research Amerykańskiego Towarzystwa Chemicznego. Ewentualne pojawienie się odpornych na szczepionki wariantów SARS-CoV-2, a także nowych koronawirusów, sprawia, że ważne jest znalezienie metod leczenia, które działają przeciwko wszystkim koronawirusom.
Teraz naukowcy przeanalizowali białka wirusowe w 27 gatunkach koronawirusa i tysiące próbek od pacjentów z Covid-19, identyfikując wysoce konserwatywne sekwencje, które mogą stanowić najlepsze cele leków. Zgłosili swoje odkrycia w Journal of Proteome Research Amerykańskiego Towarzystwa Chemicznego.
Leki często wiążą się w kieszeniach białek, które dobrze trzymają lek, powodując, że zakłóca on funkcję białka. Naukowcy mogą zidentyfikować potencjalne kieszenie wiążące lek na podstawie trójwymiarowych struktur białek wirusowych. Jednak z biegiem czasu wirusy mogą mutować swoje kieszenie białkowe, tak że leki już nie pasują.
Ale niektóre kieszenie wiążące leki są tak istotne dla funkcji białka, że nie można ich zmutować, a sekwencje te są generalnie konserwowane w czasie w tym samym wirusie i wirusach pokrewnych.
W badaniu naukowiec Matthieu Schapira i współpracownicy chcieli znaleźć najbardziej konserwowane kieszenie wiążące lek w białkach wirusowych z próbek pacjentów z Covid-19 i innych koronawirusów, ujawniając najbardziej obiecujące cele dla leków pan-koronawirusowych, podało Amerykańskie Towarzystwo Chemiczne w komunikacie prasowym na temat badań.
Zespół wykorzystał algorytm komputerowy do identyfikacji kieszeni wiążących lek w strukturach 3D 15 białek SARS-CoV-2. Następnie naukowcy znaleźli odpowiednie białka u 27 gatunków koronawirusów i porównali ich sekwencje w kieszeniach wiążących lek.
Dwa najbardziej konserwatywne miejsca podatne na leki obejmują białka (zwane odpowiednio nsp13 i nsp12), które biorą udział w replikacji i transkrypcji wirusowego RNA.
Naukowcy stwierdzili, że nowe leki przeciwwirusowe ukierunkowane na katalityczne miejsce białka nsp12 są obecnie w fazie II i III badań klinicznych nad Covid-19, a miejsce wiązania RNA w nsp13 jest wcześniej niezbadanym celem, który powinien mieć wysoki priorytet w opracowywaniu leków .
Źródło: Amerykańskie Towarzystwo Chemiczne
Podziel Się Z Przyjaciółmi:
